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巧克力囊肿手术对卵巢的伤害通常是比较大的，如果是进行的子宫及附件全切手术，那么卵巢也会被切除。

如果是进行的巧克力囊肿穿刺引流手术或者是巧克力囊肿病灶剥离术，那么可能会引起卵巢周围组织粘连，以至于卵巢不能正常排卵。

巧克力囊肿病灶剥离后窦卵泡数较剥除前确有减少，但巧囊患者本身窦卵泡数少于正常女性，所以用窦卵泡数来检测卵巢储备功能并没有AMH检测准确直接。

但卵囊剥除术后AMH会降低，也影响了卵巢储备功能。

另外，术后的电凝、缝合措施以及缝合密度对卵巢储备能力也有影响。其中卵巢的血供直接影响卵巢储备功能，所以在术后缝合时应该格外注意疏密和方法。

不论哪种手术方式，巧克力囊肿手术以后都应当卧床休息，避免过早的下床活动，避免劳累，术后一个月内禁止发生性行为。

同时，手术之后巧克力囊肿仍然有复发的可能，因此要定期复查，以防复发。

巧克力囊肿手术后影响生育吗?

巧克力囊肿手术后是否影响生育，需要根据具体的手术方式来决定。

1、如果患者没有生育过，临床医生一般会考虑患者有生育需求，尽量保留患者的生育能力。在巧克力囊肿手术时，仅切除一侧的卵巢和输卵管，对侧仍然有卵巢和输卵管，这种手术方式可能会影响生育，但大多数患者还是可以怀孕的。

2、对于卵巢巧克力囊肿，在进行巧克力囊肿手术时有可能不需要切除输卵管和卵巢，仅把囊液吸出、囊皮切掉、病灶切除，这种情况一般是不会影响女性的生育。

巧克力囊肿手术后如果患者恢复的比较好，一般建议尽早怀孕。因为怀孕后月经不会来潮，这对巧克力囊肿的治疗恢复有一定的帮助。如果长时间不来月经，有一些小的囊肿会萎缩，所以如果条件允许，建议尽早怀孕。